MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 7206

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017167	GCC	2	6	2557489	2557494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6002	NC_017167	CGG	2	6	2557507	2557512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_017167	TCCTC	2	10	2558412	2558421	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6004	NC_017167	TC	3	6	2559275	2559280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6005	NC_017167	AACGC	2	10	2560589	2560598	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6006	NC_017167	TCT	2	6	2560607	2560612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_017167	ACG	2	6	2560655	2560660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_017167	ATA	2	6	2560712	2560717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_017167	GACAGA	2	12	2560731	2560742	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6010	NC_017167	GGC	2	6	2562074	2562079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_017167	AGG	2	6	2562122	2562127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_017167	C	6	6	2562554	2562559	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6013	NC_017167	GCG	2	6	2567398	2567403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_017167	ATG	2	6	2567450	2567455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_017167	AG	3	6	2567471	2567476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_017167	CCG	2	6	2567487	2567492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6017	NC_017167	GCG	2	6	2567535	2567540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_017167	GAG	2	6	2570234	2570239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_017167	CG	3	6	2570278	2570283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6020	NC_017167	GCCT	2	8	2570307	2570314	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6021	NC_017167	CCACT	2	10	2572517	2572526	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6022	NC_017167	CAT	2	6	2572556	2572561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_017167	AAC	2	6	2572567	2572572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_017167	TGG	2	6	2572690	2572695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_017167	GAG	2	6	2572712	2572717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_017167	GCCC	2	8	2575248	2575255	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6027	NC_017167	AAGTG	2	10	2575929	2575938	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_017167	GCG	2	6	2578129	2578134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_017167	GCAG	2	8	2578157	2578164	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6030	NC_017167	TTG	2	6	2578168	2578173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_017167	CCT	2	6	2579443	2579448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6032	NC_017167	CGA	2	6	2579463	2579468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_017167	TCGGC	2	10	2580962	2580971	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6034	NC_017167	T	7	7	2580983	2580989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_017167	CCT	2	6	2586612	2586617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_017167	ATA	2	6	2586633	2586638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_017167	A	6	6	2586655	2586660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_017167	TGA	2	6	2593104	2593109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_017167	CTC	3	9	2595738	2595746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6040	NC_017167	A	6	6	2595774	2595779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_017167	AAAGG	2	10	2595788	2595797	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_017167	CCTC	2	8	2596939	2596946	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6043	NC_017167	TCCG	2	8	2596949	2596956	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6044	NC_017167	CGCCTC	2	12	2598895	2598906	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
6045	NC_017167	CG	4	8	2598930	2598937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6046	NC_017167	TG	3	6	2599097	2599102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_017167	GGC	2	6	2599104	2599109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_017167	GC	3	6	2599108	2599113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_017167	TGT	2	6	2599137	2599142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_017167	GCGA	2	8	2599147	2599154	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6051	NC_017167	GCC	2	6	2599169	2599174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6052	NC_017167	GAGCC	2	10	2599687	2599696	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6053	NC_017167	TGCA	2	8	2599831	2599838	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6054	NC_017167	AGG	2	6	2600006	2600011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_017167	TGA	2	6	2600056	2600061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_017167	GCGCG	2	10	2600131	2600140	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6057	NC_017167	TGCA	2	8	2600152	2600159	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6058	NC_017167	CAG	2	6	2601046	2601051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_017167	GCG	2	6	2602354	2602359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_017167	CG	3	6	2604359	2604364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6061	NC_017167	C	6	6	2606168	2606173	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6062	NC_017167	CGG	2	6	2606215	2606220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_017167	TTC	2	6	2606531	2606536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_017167	TCA	2	6	2606548	2606553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_017167	AG	3	6	2606561	2606566	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_017167	GAG	2	6	2606573	2606578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_017167	GCG	2	6	2608764	2608769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_017167	GC	3	6	2608782	2608787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6069	NC_017167	TCG	2	6	2608801	2608806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_017167	GCG	2	6	2608824	2608829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_017167	TCTG	2	8	2608856	2608863	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6072	NC_017167	CTC	2	6	2611263	2611268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6073	NC_017167	TCC	2	6	2613600	2613605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6074	NC_017167	TCCC	2	8	2614496	2614503	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6075	NC_017167	CCGT	2	8	2615838	2615845	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6076	NC_017167	GTT	2	6	2615865	2615870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6078	NC_017167	TTC	2	6	2615909	2615914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_017167	TCT	2	6	2615942	2615947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_017167	TAA	2	6	2616033	2616038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_017167	GTT	2	6	2616040	2616045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_017167	CGC	2	6	2616104	2616109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6083	NC_017167	CCG	2	6	2617145	2617150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6084	NC_017167	CCT	2	6	2617641	2617646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6085	NC_017167	TC	3	6	2618325	2618330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6086	NC_017167	GGAG	2	8	2618332	2618339	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_017167	ACC	2	6	2618344	2618349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6088	NC_017167	TCT	2	6	2622162	2622167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_017167	T	6	6	2622189	2622194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_017167	TA	3	6	2622250	2622255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_017167	TTA	2	6	2622313	2622318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6093	NC_017167	AC	3	6	2622359	2622364	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6094	NC_017167	CGA	2	6	2622399	2622404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_017167	GC	3	6	2623118	2623123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6096	NC_017167	CGTC	2	8	2625981	2625988	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6097	NC_017167	CGGG	2	8	2626996	2627003	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6098	NC_017167	TGC	2	6	2627016	2627021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_017167	GCT	2	6	2627022	2627027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_017167	CAT	2	6	2629202	2629207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_017167	ACC	2	6	2629249	2629254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6102	NC_017167	GA	3	6	2631060	2631065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_017167	GC	3	6	2633901	2633906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6104	NC_017167	CGC	2	6	2633923	2633928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6105	NC_017167	TGA	2	6	2633953	2633958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_017167	GTC	2	6	2633966	2633971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_017167	GC	3	6	2634065	2634070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6108	NC_017167	CG	3	6	2634100	2634105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6109	NC_017167	CGCGC	2	10	2634174	2634183	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6110	NC_017167	GATC	2	8	2634217	2634224	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6111	NC_017167	CG	4	8	2634332	2634339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6112	NC_017167	CGCGAG	2	12	2634398	2634409	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_017167	CG	3	6	2634421	2634426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6114	NC_017167	CAC	2	6	2634428	2634433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6115	NC_017167	CCT	3	9	2634456	2634464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6116	NC_017167	GC	3	6	2634465	2634470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6117	NC_017167	CAC	2	6	2634490	2634495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6118	NC_017167	TA	3	6	2634513	2634518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_017167	CA	4	8	2634525	2634532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6120	NC_017167	CCTT	2	8	2636684	2636691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6121	NC_017167	CTC	2	6	2637482	2637487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6122	NC_017167	CCGGC	2	10	2637521	2637530	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6123	NC_017167	T	6	6	2639653	2639658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_017167	CTC	2	6	2640602	2640607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6125	NC_017167	CCAG	2	8	2641880	2641887	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6126	NC_017167	CT	3	6	2641930	2641935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6127	NC_017167	CTC	2	6	2643493	2643498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6128	NC_017167	TCC	2	6	2644894	2644899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6129	NC_017167	CAT	2	6	2645549	2645554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_017167	CGA	2	6	2645558	2645563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6131	NC_017167	TAACA	2	10	2645572	2645581	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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6133	NC_017167	CG	3	6	2645644	2645649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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